O Aeroporto Internacional de Pelotas tem sua história ligada ao pioneirismo da aviação comercial. Ele serviu como pouso intermediário e primeira escala, ainda nos anos 20, do século passado, dos vôos da recém-criada Viação Aérea Riograndense. 


Durante muitos anos, foi através dele que as populações da região da fronteira uruguaia embarcavam para chegar a Porto Alegre, distante pouco menos de 300 quilômetros. Naquele tempo, em aeronaves movidas a motor de pistão, o percurso demorava mais de uma hora.

Pelotas é hoje a principal porta para as aeronaves da FAB – Força Aérea Brasileira – que demandam a base brasileira da Antártida. Sem vôos regulares, o aeroporto da cidade ainda mantém seu status de internacionalização, mas é freqüentado apenas por aeronaves da aviação executiva e agrícola.